1999年5月26日，九龙油尖警区一队探员，带同阿芳到达现场。阿芳疑因惧怕不敢上楼，只在楼下指出案发单位，警员带备口罩及以胶袋包脚，以防尸虫咬噬。当单位大门打开后，一阵尸臭味扑鼻而来；开灯后，Hello Kitty洋娃娃就在眼前不远，倚在走廊墙边。探员以铁枝轻刺公仔内收藏的头颅，感觉内有坚硬物体。由于死者人头未完全烹熟，洋娃娃仍渗出腥臭血水。单位内亦发现两个仍未洗净的不锈钢煲及瓦煲，相信是曾经烹煮人头的器皿。两煲周围满布尸虫，煲内甚至盛着充满恶臭的渣滓。
法医官奉召到场后，在Hello Kitty洋娃娃内发现一个女性人头，洋娃娃的棉花满布尸虫，头骨已被人煲熟，由于皮肉及头发组织已被破坏，无法进行DNA化验。探员最终在现场检走一批重要证物，包括一个无门冰箱、一把铁锤及一个怀疑曾作烹尸用的瓦煲。
警方随即追捕各被告，期望在记者报道前将疑凶拘捕。1999年5月27日，当时首被告陈文乐与妻子阿佩及初生之婴儿已搬离案发单，位并正在投靠朋友地方居住于葵涌石篱邨石宁楼十七楼一单位，但警方经调查后便很快掌握此资料，并派出一队共四名探员到达该单位一举将陈文乐及阿佩捕获。同一时间，多队探员亦根据调查所得资料搜查多处地方，以期追捕梁胜祖及梁伟伦，包括他们之居住地址，但都不得要领。翌日，次被告梁胜祖主动投案，而第三被告梁伟伦在报章上得知事件，逃往广西。
由于知道梁已离境，警方遂将资料交给国际刑警、公共安全专家和入境处协助追捕，直至年2000年2月14日，中国大陆公共安全专家在执行其他任务时巧遇梁伟伦，因他未能出示身丄份证明文件，遭公共安全专家扣押，其后得悉他在港被通缉，移交香港受审。
审讯
2000年10月9日，案件于香港高等**开审，翌日成为香港多份报章的头条新闻。3名被告被控以谋杀罪、非法禁锢及阻止尸体合法殓葬共三项罪名。在调查初期，警方苦于没有足够证据，证明死者就是樊敏仪，但因被告已承认非法处理尸体等控罪，加上污点证人阿芳的口供，于是落案控告三人谋杀罪名。
3名被告各自承认禁锢或阻止尸体合法殓葬，但全部否认谋杀罪，在自辩时亦互相推卸责任，如第二、三被告就声称一切都是受第一被告陈文乐所指使。后来的证人供词指陈为B社会和胜和的成员。
在开庭首日，死者男友吴志远、家姑及凶案现场楼下二楼的情侣，及楼上一住客均曾出庭作供。吴志远指1999年3月13日后，已再没有见过死者，家姑指案发当日有二人上门找死者，另外楼上、楼下住客亦曾听到单位传出女子的叫喊声。
审讯期间，警员经常要将案中的重要证物Hello Kitty洋娃娃搬入法庭，亦要将女死者的头骨、藏尸冰箱及煮尸用的瓦煲呈堂，令法庭传出尸臭。当其中一名被告供述如何从椅子上跳下，以膝盖压在受害人身上时，另一名被告竟在庭上发笑（应为三人中最惨无人道的陈文乐）。
审讯时，庭外亦出现怪事。当辩方律师指被告只是非法处理尸体，根本不用谈得太多之际，庭上的灯闪动大作，庭内所有人都非常愕然。梁胜祖在晚上押返羁留所，深夜他向着看守员称：“我撞到鬼（我看到鬼）”，他指在庭上看到的女性，都是女死者樊敏仪的容貌。
判刑
踏入2000年11月，审讯进入尾声。**阮云道指，控方证人均力指首被告陈文乐是“大耳窿（高利贷）”、B社会大佬（头目），参与贩毒，但不管这些刑事案底是否真有其事，今次碎尸案陪审团只应集中判断三名被告陈文乐、梁胜祖和梁伟伦有没有殴打虐待和肢解樊敏仪。
辩方三位大律师指，出任控方特赦证人的女童证供薄弱，亦没有亲眼见到樊临死前的情形，可能并非三名被告亲手杀害樊等等，阮云道表示特赦证人必须说真话，其证供可信程度不应因为她年纪小而打折扣。
2000年12月6日，陪审团以六比一大多数作，裁定三被告谋杀罪名不成立，误杀罪名成立。**阮云道决定以最严厉的判刑，判处3人终身监禁。