当地时间19日，在世卫组织举行的新冠肺炎例行发布会上， 世卫组织卫生紧急项目技术主管玛丽亚·范·科霍夫表示，北京出现的新冠病毒的基因序列已被上传分享，显示与欧洲新冠毒株密切相关。
6月18日晚，中国疾病预防控制中心通过“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”发布了三条数据——北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)以及环境样本基因组序列数据(NMDC60013903-03)，均是最近北京爆发的病毒样本。
这3个样本采集于2020年6月11日。由中国疾控中心病毒病预防控制所快速测序并且在全球共享流感数据倡议组织(GISAID)共享。
最近北京爆发的病毒样本的序列落在同一个进化簇中，该进化簇中很多都是来自欧洲的样本，与前期采样的3个输入型的病毒的基因序列很不一样。
在全球冠状病毒的进化架构中，和这3个北京的新冠病毒序列最接近的为来自捷克、中国台湾、希腊和葡萄牙的新冠序列。
按地区分布来看，在亚洲冠状病毒的进化架构中，北京的序列和来自捷克、中国台湾、丹麦、哥伦比亚、以色列和奥地利的序列很接近。
在欧洲冠状病毒的进化架构中，北京的序列和来自捷克、丹麦等许多欧洲国家的序列很接近，其中和来自葡萄牙和瑞典的基因序列只相差1个突变。
因此，从基因序列分析来看，北京最近传播的新冠病毒与欧洲流行的病毒有关。但是因为与许多国家/地区的序列类似，暂且无法定论它起源于何处，何时传入北京的。
世卫组织卫生紧急项目负责人迈克尔·瑞安在当地时间19日的新冠肺炎例行发布会上也称，目前有不同毒株在传播，不代表疾病来自欧洲，很有可能的是此次病毒由北京以外输入，现在重要的是要确定病毒传播的时间以及传播链，世卫组织很高兴看到北京采取的高强度调查，以确保发现聚集性传播的源头。
迈克尔·瑞安据悉，截至北京时间6月20日，捷克已累计确诊17271例，现有确诊442例;
丹麦，已累计确诊12391例，现有确诊509例;
哥伦比亚已累计确诊623276例，现有确诊37243例;
以色列已累计确诊20339例，现有确诊4449例;
奥地利已累计确诊17271例，现有确诊442;
希腊已累计确诊3237例，现有确诊1674例;
葡萄牙已累计确诊38464例，现有确诊12460例。
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