1、徐福下落之谜
秦始皇想长生不老，方士徐福就投其所好，自称能出海求得仙丹。第一次出海无功而返，徐福辩称是受大鱼所阻，公元前219年他带着3000童男童女、一批强弩射手、各行业的能工巧匠和农作物种子再次出海，这一去就再无消息。后世有不少学者认为徐福确实到达了他所说的“神山”，也就是今天的日本，既然没有什么仙丹，他索性就在那里扎下根来。更有人考证徐福就是日本首代天皇神武天皇，而随他到达日本的童男童女，就是今天日本人的先祖。日本学术界也有不少史料记述徐福到日本的情况，比如林下见林在《异称日本传》里就写道：“相传纪伊国熊野之山下有徐福墓。熊野新宫东南有蓬莱山，山前有徐福祠。”新井君美在《同文通考》中则说：“今熊野附近有地曰秦住，土人相传为徐福居住之旧地。”
2、建文帝生死之谜
研读《明史》，建文帝朱允炆的下落是一个绕不过去的谜题，靖难之役燕王朱棣攻入南京，皇宫中起了一把大火，建文帝自此不知所终。朱棣随便找了一具烧焦的尸体以天子礼下葬，对外宣称建文帝已被烧死，但私下里作为篡位者的他心中没有太平过一天。朱棣称帝后遍搜天下，找寻建文帝的下落，包括郑和下西洋很可能也肩负着去海外搜寻的任务，但建文帝就像人间蒸发了一般。研究明史的学者徐作生认为，建文帝出亡后曾藏在江苏吴县鼋山普济寺内，后来朱棣的首席谋士姚广孝归隐禅寺，把建文帝隐匿于穹窿山皇驾庵，直到1423年病死于此，就葬在皇驾庵后的小山坡上。这一结论并没有得到学界的广泛认同，疑点在于姚广孝对朱棣的忠诚度极高，也知道这位主子的霹雳手段，没有必要为一个废帝冒杀头的风险。总之，直到今天对建文帝的下落，始终没有一个令人信服的结论。
3. 彭加木失踪之谜
1980年6月17日，著名科学家彭加木在新疆罗布泊考察时失踪，近40年后的今天，他不仅没有被人们遗忘，反而时不时地被年轻人所关注、所提及、所议论、所猜测。彭加木带队的科考队因缺水和汽油被困，不得不向附近驻军求援，军方答应第二天用直升机运水解困。就在次日一早，彭加木留下一张写着“我往东去找水井”的纸条，独自离开了营地，这一去就再也没有回来。多年来曾有过几次寻找彭加木的行动，2005年和2007年还分别找到过疑似其遗体的干尸，但DNA检测都证明它们并不是彭加木的遗体。围绕着彭加木的离奇失踪，许多传奇性的故事也流传开来，有说他是被苏联特务劫持的，也有跟所谓的双鱼玉佩和生化僵尸有关的，基本都是牵强附会。
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